International Biodiversity Day - 22 May 2002 Symposium: Ten years after Rio. What future for biodiversity in Belgium?

Be-BIF, a prototype national node of the Global Biodiversity Information Facility Mergen P., Minani C., Dubrowski M., Herzog R. Belgian Biodiversity Information Facility (Be-BIF), Université Libre de Bruxelles, Campus de la Plaine des Manoeuvres, Boulevard du Triomphe, bâtiment NO, B-1050- Brussels, Belgium The fulfillment of the main goals of the Convention on Biodiversity (Rio, 1992) is difficult to achieve because of the low availability of the data and their extreme fragmentation. Belgium as a participant country of the Global Biodiversity Information Facility, GBIF (OECD Megascience Forum, 1996) has to promote the sharing of biodiversity data in GBIF under a common set of standards and form a node or nodes, accessible via GBIF, which will provide access to biodiversity data. At a meeting in 2000, initiated by the OCTC, the realisation at Belgian level of a joint information system, which could serve as a prototype for the GBIF system, was decided. This was the birth of the Be-BIF project assigned by the OSTC to the Belgian EMBnet Node (BEN), already in charge of the conception and maintenance of the biosequence and genomic databases and associated software (http://www.be.embnet.org). The main goal is the construction of a prototype of a biodiversity information infrastructure, which could enable the management and exhibition of biodiversity data presently available in the Belgian scientific community. SRS, which is a highly flexible scalable platform for biological data, is foreseen as a tool to accomplish this task. SRS, which is already largely used in multiple scientific fields, enables powerful database interoperability, allows complex queries and guaranties total data integrity. In a period of one year, we intend to build up a prototype, with a range of selected partners who already possess computerised biodiversity data in different fields (fauna, flora, terrestrial and aquatic ecosystems, etc.). Opportunity will be given to the partners to integrate their data into the prototype. Identified partners will receive adequate funding to implement the in-house conversion procedures to make their data available to the Be-BIF system. During the deployment phase the partners will be equipped with the adequate material to set up a local SRS computer interface. During the analysing phase the partners should provide assistance to the Be-BIF developing team in order to identify suitable data to be integrated to the system and develop the data model. During the implementation phase the partners are supposed to participate to the deployment of the integrated computer interfaces by providing all or part of their data in the format defined by the project. The partners can of course choose a limit of confidentiality regarding the data they wish to integrate into the Be-BIF system. At the end of this project we will provide access to a distributed information system covering several aspects related to the biodiversity available in Belgium, possibly including Belgian collections about Central Africa. A well-structured and organised biodiversity server at the Belgian level will be of a great scientific interest and is essential to our participation in the GBIF program. The technology implemented in our system could serve as a model of an international Biodiversity server. Belgium would in this way show its real dedication to the GBIF program and acts as an active participant country of the whole project. Already contacted potential Belgian partners: BELNET BIODIV, Royal Belgian Institute of Natural Sciences, National Botanic Garden of Belgium, Royal Museum for Central Africa, Universities, governmental institutions … Interested by a participation to this project as a partner institution??? Do not hesitate to contact us, we will provide you with all further information! Robert Herzog, rherzog@ulb.ac.be - Patricia Mergen, pmergen@ben.vub.ac.be Be-BIF, un prototype pour un carrefour national du Global Biodiversity Information Facility Mergen P., Minani C., Dubrowski M., Herzog R. Belgian Biodiversity Information Facility (Be-BIF), Université Libre de Bruxelles, Campus de la Plaine des Manoeuvres, Boulevard du Triomphe, bâtiment NO, B-1050- Bruxelles, Belgique L'accomplissement des buts principaux de la Convention sur la Biodiversité (Rio, 1992) est rendu difficile par la faible disponibilité des données et de leur extrême fragmentation. La Belgique en tant que pays participant à la "Global Biodiversity Information Facility", GBIF (OCDE Megascience Forum, 1996) doit promouvoir le partage des données de biodiversité au sein de GBIF sous un format commun standard et former un ou plusieurs carrefours, accessibles via le GBIF, qui fournissent un accès aisé aux données sur la biodiversité. Lors d'une réunion, initiée par les SSTC, en 2000, la mise en place au niveau belge d'un prototype de système d'information commun, qui pourrait servir de prototype pour le GBIF, a été décidée. C'est la naissance du projet Be-BIF, qui a été attribué par les SSTC au "Belgian EMBnet Node (BEN), déjà responsable de la conception et de la maintenance des bases de données et des outils logiciels en matière de bioséquences et de génomique. Le but principal est la construction d'un prototype d'infrastructure d'information pour la biodiversité, qui puisse permettre la gestion et l'exposition des données sur la biodiversité actuellement disponibles au niveau de la communauté scientifique belge. SRS qui est un moteur de recherche et une interface extrêmement flexible et modulable pour les données biologiques, est pressentie comme instrument pour l'accomplissement de cette tâche. SRS est déjà largement utilisée dans de multiples domaines scientifiques et permet la composition aisée de requêtes croisées entre bases de données ; il garantit aussi une intégrité totale des données. Sur une période d'un an, nous avons l'intention de construire ce prototype avec une série de partenaires qui disposent déjà de données de biodiversité informatisées dans différents domaines (faune, flore, écosystèmes aquatiques et terrestres …). L'opportunité sera donnée aux partenaires d'intégrer leurs données au prototype. Les partenaires identifiés recevront une quote-part de fonctionnement leur permettant d'implémenter localement les procédures de conversion qui rendront leurs données disponibles pour le système Be-BIF. Pendant la phase de mise en place, les partenaires seront équipés avec le matériel adéquat pour permettre l'installation de l'interface SRS locale. Les partenaires pourront bien sûr choisir une limite de confidentialité, concernant les données qu'ils souhaitent intégrer au système Be-BIF. Durant la phase d'analyse les partenaires devront apporter leur assistance à l'équipe de développement, afin d'identifier les données susceptibles d'être intégrées au système et la définition du modèle des données. Pendant la phase d'implémentation les partenaires seront supposés participer à la mise en place des interfaces informatiques intégrées en fournissant tout ou partie de leurs données dans le format défini par le projet. A l'issue du projet, nous disposerons d'un système de distribution d'information couvrant divers aspects de la biodiversité disponible en Belgique et comprenant si possible les importantes collections belges sur l'Afrique Centrale. Un serveur d'information sur la biodiversité, bien organisé et structuré au niveau belge, sera d'un grand intérêt scientifique et est essentiel à notre participation au programme GBIF. Le système pourrait être présenté au GBIF et proposé comme prototype d'un serveur système à plus grande échelle. La Belgique matérialise ainsi son intérêt réel pour le programme GBIF et sera perçue comme un pays participant actif au niveau international. Partenaires potentiels déjà contactés: BELNET BIODIV, Institut Royale des Sciences Naturelles de Belgique , Jardin botanique national, Musée Royale de l'Afrique Centrale, Universités, Institutions gouvernementales … Intéressé par une participation à ce projet en tant qu'institution partenaire ??? N'hésitez pas à nous contacter, nous vous fournirons toutes les informations nécessaires! Robert Herzog, rherzog@ulb.ac.be - Patricia Mergen, pmergen@ben.vub.ac.be Be-BIF, ein Prototyp für einen nationaler Knotenpunkt für die Global Biodiversity Information Facility Mergen P., Minani C., Dubrowski M., Herzog R. Belgian Biodiversity Information Facility (Be-BIF), Université Libre de Bruxelles, Campus de la Plaine des Manoeuvres, Boulevard du Triomphe, bâtiment NO, B-1050- Brüssel, Belgien Die Vollendung der Hauptziele der Convention für Biodiversität (Rio, 1996) ist nur schwer zu erreichen wegen der schwachen Verfügbarkeit der Daten und ihre extreme Fragmentation. Belgien als Mitgliedstaat der Global Biodiversity Information Facility, GBIF (OWZE Megascience Forum, 1996), muß die gemeinsame Benutzung der Biodiversitätdaten im GBIF unter einem gemeinsamen und standardisierte Format fördern et ein oder mehrere Knotenpunkte bilden, die durch GBIF erreichbar sind und den Zugang an die Biodiversitätsdaten ermöglichen. Während einer Versammlung, durch die DWKT eingeleitet, in 2000 wurde der Entschluß getroffen auf Belgischen Ebene ein gemeinsames Informationssystem auf die Beine zu stellen, der als Prototyp für GBIF dienen könnte. Das war die Geburt des Be-BIF Projektes, die durch die DWKT dem " Belgian EMBnet Node (BEN)" zugestanden wurde, der schon verantwortlich ist für die Konzeption und den Unterhalt der Biosequenz und genetischen Datenbanken. Das Hauptziel ist die Herstellung einer Informationsinfrastucksturprototyp für die Biodiversität, die Verwaltung und die Exposition der zurzeit verfügbaren Biodiversitätsdaten an die Belgische wissenschaftliche Gemeinschaft ermöglicht. SRS, die eine extreme biegsame und skalierbare Interface für biologische Daten ist, wird als Instrument zur Vollendung dieser Aufgabe angesehen. SRS, die schon reichlich in verschiedenen wissenschaftliche Gebiete benutzt wird, ermöglicht Kreuzabfragen zwischen Datenbanken und stellt die totale Integrität der Daten fest. In einem Jahr, haben wir vor ein Prototyp zu erstellen mit einer Reihe von ausgesuchten Partner, die schon über informalisierte Biodiversitätsdaten in verschiedenen Gebieten verfügen (Fauna, Flora, aquatische und terrestrische Ökosysteme ... ). Die Gelegenheit wird den Partner gegeben, Ihre Daten dem Prototyp beizufügen. Ausgesuchte Partner bekommen einen Beitragsanteil um die Umrechnungsverfahren der Daten lokal durchzuführen, die die Daten für Be-BIF verfügbar machen. Während der auf Beinsetzungsphase, werden die Partner mit dem angepaßten Material ausgerüstet, um die Installation der lokalen SRS Server zu ermöglichen. Die Partner können natürlich wählen, wo sie die Vertraulichkeitsgrenze der Daten die sie in das Be-BIF System einfügen wollen. Während der Analysephase, müssen die Partner dem Entwerfungsteam ihre Hilfe anbieten, um die Daten zu identifizieren, die ins System einbaufähig sind. Während der Implementierungsphase sollen die Partner auf die Aufbeinstellung der integrierten Computerinterfaces mitarbeiten indem sie alle oder einen Teil ihrer Daten im gewünschtem Format dem System zur Verfügung stellen. Am Ende des Projektes, werden wir über ein Informationsausteilungssystem verfügen, die alle in Belgien verfügbare Hauptaspekte der Biodiversität erfaßt, inklusiv die zahlreichen Belgische Sammlungen über Zentralafrika. Ein gut organisierter und strukturierter Server auf Belgischer Ebene wird von einem wichtigen wissenschaftlichen Interessen sein und ist zu unseren Mitarbeit am GBIF Programm notwendig. Das System könnte am GBIF vorgeführt werden und als internationaler Biodiversitätsserver vorgestellt werden. Belgien wird dadurch sein wahres Interessen im GBIF Programm zeigen und als aktives Mitgliedstaat dastehen auf internationaler Ebene. Bereits angesprochene potenzielle Partner: BELNET BIODIV, Belgisches Königliches Institut für Naturwissenschaften, Nationaler Botanischer Garten, Museum für Zentralafrika, Universitäten, Regierungsinstitutionen ... Interessiert bei eine Mitarbeit, als Partnerinstitution zu diesem Projekt ??? Zögern Sie nicht uns anzusprechen, wir teilen Ihnen alle notwendige Informationen mit! Robert Herzog, rherzog@ulb.ac.be - Patricia Mergen, pmergen@ben.vub.ac.be Be-BIF, een prototype van nationaal knooppunt voor de Global Biodiversity Information Facility Mergen P., Minani C., Dubrowski M., Herzog R. Belgian Biodiversity Information Facility (Be-BIF), Université Libre de Bruxelles, Campus de la Plaine des Manoeuvres, Boulevard du Triomphe, bâtiment NO, B-1050- Brussel, België Het vervullen van de hoofddoelen van de Conventie van biodiversiteit (Rio, 1992) is moeilijk door de zwakke beschikbaarheid van de gegevens en hun extreme fragmentatie. België, als een lidstaat van de Global Biodiversity Information Facility, GBIF (OESO Megascience Forum, 1966) moet het delen van de biodiversiteitgegevens in de GBIF in een algemene en standaard formaat bevorderen en een of meer knopenpunten, bereikbaar door GBIF, vormen die toegang tot de biodiversiteitgegevens verschaffen. Tijdens een vergadering, door de DWTC ingeroepen, word de herstelling van een of Belgische vlak gemeenzame informatie systeem beslist, die als prototype kan dienen voor de GBIF. Dat was de geboorte van het Be-BIF project, die door de DWTC aan de" Belgian EMBnet Node (BEN)" is gegeven, die al verantwoordelijk is voor het ontwerpen en het onderhoud van de biosequens en genetische databanken. Het hoofddoel is het opbouwen van een prototype informatie infrastructuur voor biodiversiteit, die het beheer en het verspreiding van biodiversiteitgegevens, die momenteel beschikbaar zijn in de Belgische wetenschappelijke gemeenschap, mogelijk te maken. SRS, een extreem buigzame en regelbare data management systeem voor biologische gegevens, is als instrument voor het voldoen van deze taak bekeken. SRS is reeds heel wijd verspreid in verschillende biologische en andere wetenschappelijke velden. Over een periode van een jaar, zijn we van plan een prototype op te bouwen met een reeks gekozen partners, die over geïnformatiseerde biodiversiteitgegevens beschikken in verschillende gebieden (fauna, flora, aquatische en terrestrische ecosystemen …). De gelegenheid word aan de partners gegeven hun gegevens in het prototype te integreren. Bepaalde partners krijgen een gepaste werkaandeel om de lokale omzettingprocedure te doen, zodat de gegevens voor het Be-BIF systeem bereikbaar worden. Gedurende de startfase worden de partners met het adequaat materiaal uitgerust om de lokale omzetting naar de SRS interface te verwezenlijken. Het is vanzelfsprekend dat de partners de geheimhoudinggrens van de gegevens die ze in het systeem willen plaatsen, kunnen bepalen. Gedurende de analysefase moeten de partners met de ontwikkelingsploeg samenwerken, om de gegevens te identificeren die in vraag komen voor het systeem. Gedurende de implementatiefase verplichten de partners zich aan mee te werken aan de conceptie van de integreerde computerinterface, met de bereikstelling van alle of een deel van hun gegevens in het door het project gekozen formaat. Op het einde van het project zullen we over een informatieverspreidingsysteem beschikken, dat meerdere hoofdaspecten die met biodiversiteit in België verbonden zijn, dekt, inclusief de belangrijke verzamelingen over Centraal Afrika. Een goed georganiseerd en structureerde server voor biodiversiteit op Belgisch vlak zal een belangrijke wettenschappelijke interest hebben en is een belangrijke troef voor ons meewerken in het GBIF programma. Het systeem kan op het GBIF voorgesteld werden en als model voor een internationaal biodiversiteit server aangeboden worden. België kan zo zijn ware interest in het GBIF programma tonen en als een actief lidstaat op internationaal vlak aangezien werden. Al aangesproken potentiële partners: BELNET BIODIV, Koninklijk Instituut voor Natuurwetenschappen, Nationaal Botanisch Tuin, Koninklijk Museum voor Centraal-Afrika, Universiteiten, regeringsorganen ...). Geïnteresseerd door een deelneming aan dit project als partnerinstitutie??? Spreek ons aan, we bieden u al de noodzakelijke informatie aan! Robert Herzog, rherzog@ulb.ac.be - Patricia Mergen, pmergen@ben.vub.ac.be

 

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